MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 chromosome

Total Repeats: 97442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013008	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	254791137
2	NC_013008	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791137
3	NC_013008	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791137
4	NC_013008	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791137
5	NC_013008	CAC	3	9	225	233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791137
6	NC_013008	ACCATT	2	12	238	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791137
7	NC_013008	A	6	6	292	297	100 %	0 %	0 %	0 %	254791137
8	NC_013008	T	8	8	320	327	0 %	100 %	0 %	0 %	254791137
9	NC_013008	AAC	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791137
10	NC_013008	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791138
11	NC_013008	CAGG	2	8	437	444	25 %	0 %	50 %	25 %	254791138
12	NC_013008	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	254791138
13	NC_013008	ACCA	2	8	483	490	50 %	0 %	0 %	50 %	254791138
14	NC_013008	TGG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
15	NC_013008	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
16	NC_013008	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	254791138
17	NC_013008	CGC	3	9	587	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791138
18	NC_013008	TCG	2	6	631	636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
19	NC_013008	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	254791138
20	NC_013008	GC	3	6	771	776	0 %	0 %	50 %	50 %	254791138
21	NC_013008	CTG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
22	NC_013008	CCG	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791138
23	NC_013008	CCG	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791138
24	NC_013008	TGG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
25	NC_013008	ACT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
26	NC_013008	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791138
27	NC_013008	GCTG	2	8	992	999	0 %	25 %	50 %	25 %	254791138
28	NC_013008	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791138
29	NC_013008	GGAC	2	8	1030	1037	25 %	0 %	50 %	25 %	254791138
30	NC_013008	TA	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	254791138
31	NC_013008	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791138
32	NC_013008	TTC	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791138
33	NC_013008	TGA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
34	NC_013008	AAT	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791138
35	NC_013008	GGC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791138
36	NC_013008	GC	3	6	1350	1355	0 %	0 %	50 %	50 %	254791138
37	NC_013008	TGC	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
38	NC_013008	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
39	NC_013008	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
40	NC_013008	TG	3	6	1452	1457	0 %	50 %	50 %	0 %	254791138
41	NC_013008	AAG	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791138
42	NC_013008	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791138
43	NC_013008	TCT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791138
44	NC_013008	GAT	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
45	NC_013008	TCA	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
46	NC_013008	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
47	NC_013008	GAA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791138
48	NC_013008	GAA	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791138
49	NC_013008	ATC	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
50	NC_013008	TTG	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791138
51	NC_013008	CCAG	2	8	2020	2027	25 %	0 %	25 %	50 %	254791138
52	NC_013008	TCG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
53	NC_013008	TAC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791138
54	NC_013008	TGA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
55	NC_013008	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
56	NC_013008	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
57	NC_013008	ATTGAA	2	12	2448	2459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254791138
58	NC_013008	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
59	NC_013008	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791138
60	NC_013008	CG	4	8	2543	2550	0 %	0 %	50 %	50 %	254791138
61	NC_013008	TGA	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
62	NC_013008	TGA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791138
63	NC_013008	TAT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791138
64	NC_013008	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791138
65	NC_013008	GCG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791139
66	NC_013008	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791139
67	NC_013008	GCAA	2	8	3047	3054	50 %	0 %	25 %	25 %	254791139
68	NC_013008	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791139
69	NC_013008	ATGA	2	8	3145	3152	50 %	25 %	25 %	0 %	254791139
70	NC_013008	GCA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791139
71	NC_013008	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791139
72	NC_013008	TGA	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791139
73	NC_013008	GAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791139
74	NC_013008	CAT	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791139
75	NC_013008	CAGC	2	8	3300	3307	25 %	0 %	25 %	50 %	254791139
76	NC_013008	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791139
77	NC_013008	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791139
78	NC_013008	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	254791139
79	NC_013008	TTCA	2	8	3445	3452	25 %	50 %	0 %	25 %	254791139
80	NC_013008	TGA	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791139
81	NC_013008	AGCG	2	8	3582	3589	25 %	0 %	50 %	25 %	254791139
82	NC_013008	TCCGGC	2	12	3595	3606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254791139
83	NC_013008	TG	3	6	3623	3628	0 %	50 %	50 %	0 %	254791139
84	NC_013008	CGG	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791139
85	NC_013008	T	6	6	3838	3843	0 %	100 %	0 %	0 %	254791140
86	NC_013008	CTGA	2	8	3868	3875	25 %	25 %	25 %	25 %	254791140
87	NC_013008	TGA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
88	NC_013008	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
89	NC_013008	GC	3	6	3978	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	254791140
90	NC_013008	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791140
91	NC_013008	GGC	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791140
92	NC_013008	TGA	3	9	4341	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
93	NC_013008	CTA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791140
94	NC_013008	GC	3	6	4459	4464	0 %	0 %	50 %	50 %	254791140
95	NC_013008	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791140
96	NC_013008	CTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791140
97	NC_013008	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791140
98	NC_013008	AAC	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791140
99	NC_013008	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791140
100	NC_013008	CCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791140
101	NC_013008	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791140
102	NC_013008	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
103	NC_013008	AG	3	6	4899	4904	50 %	0 %	50 %	0 %	254791140
104	NC_013008	CCG	2	6	4991	4996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791140
105	NC_013008	TGC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791140
106	NC_013008	TGA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791140
107	NC_013008	ATC	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791140
108	NC_013008	TTA	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791141
109	NC_013008	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791141
110	NC_013008	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791141
111	NC_013008	CCG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791141
112	NC_013008	CCG	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791141
113	NC_013008	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791141
114	NC_013008	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791141
115	NC_013008	CGG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791141
116	NC_013008	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791142
117	NC_013008	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254791142
118	NC_013008	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791142
119	NC_013008	AAG	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791142
120	NC_013008	CAGT	2	8	5783	5790	25 %	25 %	25 %	25 %	254791142
121	NC_013008	AAT	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791142
122	NC_013008	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791142
123	NC_013008	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791142
124	NC_013008	TTC	2	6	5929	5934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791142
125	NC_013008	CAC	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791142
126	NC_013008	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791142
127	NC_013008	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791142
128	NC_013008	TGA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791142
129	NC_013008	GCGG	2	8	6116	6123	0 %	0 %	75 %	25 %	254791142
130	NC_013008	AAATCG	2	12	6169	6180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254791142
131	NC_013008	AGCG	2	8	6287	6294	25 %	0 %	50 %	25 %	254791142
132	NC_013008	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791142
133	NC_013008	GTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791142
134	NC_013008	CAT	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791143
135	NC_013008	GCC	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
136	NC_013008	GTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791143
137	NC_013008	AGA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791143
138	NC_013008	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791143
139	NC_013008	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
140	NC_013008	TGCCGC	2	12	7125	7136	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254791143
141	NC_013008	CGC	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
142	NC_013008	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791143
143	NC_013008	GCCA	2	8	7244	7251	25 %	0 %	25 %	50 %	254791143
144	NC_013008	TTA	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791143
145	NC_013008	CAG	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791143
146	NC_013008	AAT	2	6	7425	7430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791143
147	NC_013008	CG	3	6	7571	7576	0 %	0 %	50 %	50 %	254791143
148	NC_013008	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791143
149	NC_013008	CG	3	6	7763	7768	0 %	0 %	50 %	50 %	254791143
150	NC_013008	CAA	2	6	7897	7902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791143
151	NC_013008	TAA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254791143
152	NC_013008	A	6	6	7963	7968	100 %	0 %	0 %	0 %	254791143
153	NC_013008	GCAT	2	8	7973	7980	25 %	25 %	25 %	25 %	254791143
154	NC_013008	ACC	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791144
155	NC_013008	CAAC	2	8	8352	8359	50 %	0 %	0 %	50 %	254791144
156	NC_013008	TC	3	6	8363	8368	0 %	50 %	0 %	50 %	254791144
157	NC_013008	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	254791144
158	NC_013008	TTGA	2	8	8405	8412	25 %	50 %	25 %	0 %	254791144
159	NC_013008	CAG	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791144
160	NC_013008	CG	3	6	8450	8455	0 %	0 %	50 %	50 %	254791144
161	NC_013008	CAG	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791144
162	NC_013008	TGC	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
163	NC_013008	AAG	2	6	8697	8702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791144
164	NC_013008	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
165	NC_013008	TTG	2	6	8787	8792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254791144
166	NC_013008	AAGA	2	8	8828	8835	75 %	0 %	25 %	0 %	254791144
167	NC_013008	AGA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791144
168	NC_013008	TAC	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791144
169	NC_013008	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
170	NC_013008	GCTG	2	8	9007	9014	0 %	25 %	50 %	25 %	254791144
171	NC_013008	GCA	2	6	9103	9108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791144
172	NC_013008	A	6	6	9183	9188	100 %	0 %	0 %	0 %	254791144
173	NC_013008	CTG	2	6	9200	9205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791144
174	NC_013008	TGA	2	6	9321	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254791145
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176	NC_013008	GAA	2	6	9407	9412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791145
177	NC_013008	ATC	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791145
178	NC_013008	TG	3	6	9495	9500	0 %	50 %	50 %	0 %	254791145
179	NC_013008	TGG	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791145
180	NC_013008	CAC	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254791145
181	NC_013008	CGT	2	6	9560	9565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791145
182	NC_013008	GGTG	2	8	9679	9686	0 %	25 %	75 %	0 %	254791145
183	NC_013008	CGTAC	2	10	9805	9814	20 %	20 %	20 %	40 %	254791145
184	NC_013008	TGC	2	6	9865	9870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791145
185	NC_013008	A	7	7	9909	9915	100 %	0 %	0 %	0 %	254791145
186	NC_013008	AGAT	2	8	10012	10019	50 %	25 %	25 %	0 %	254791146
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188	NC_013008	GCG	2	6	10069	10074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254791146
189	NC_013008	CAG	2	6	10098	10103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791146
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193	NC_013008	T	6	6	10332	10337	0 %	100 %	0 %	0 %	254791146
194	NC_013008	CAG	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791146
195	NC_013008	GCC	2	6	10371	10376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254791146
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199	NC_013008	CGCGC	2	10	10792	10801	0 %	0 %	40 %	60 %	254791147
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210	NC_013008	T	6	6	11373	11378	0 %	100 %	0 %	0 %	254791147
211	NC_013008	GTC	2	6	11402	11407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791148
212	NC_013008	CAGT	2	8	11514	11521	25 %	25 %	25 %	25 %	254791148
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228	NC_013008	TGGT	2	8	12325	12332	0 %	50 %	50 %	0 %	254791150
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231	NC_013008	CAT	2	6	12440	12445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254791150
232	NC_013008	ATT	2	6	12456	12461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254791150
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242	NC_013008	CGA	2	6	12800	12805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791150
243	NC_013008	A	6	6	12817	12822	100 %	0 %	0 %	0 %	254791150
244	NC_013008	CAAC	2	8	12838	12845	50 %	0 %	0 %	50 %	254791150
245	NC_013008	GTG	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791150
246	NC_013008	GAA	2	6	12903	12908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791150
247	NC_013008	AAGA	2	8	12912	12919	75 %	0 %	25 %	0 %	254791150
248	NC_013008	AAG	2	6	12967	12972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791150
249	NC_013008	CAG	2	6	13008	13013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791150
250	NC_013008	CGA	2	6	13181	13186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254791150
251	NC_013008	TGG	2	6	13199	13204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791150
252	NC_013008	AGA	2	6	13228	13233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254791150
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254	NC_013008	GTG	2	6	13315	13320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254791150
255	NC_013008	CTG	3	9	13347	13355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791150
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257	NC_013008	CCAT	2	8	13489	13496	25 %	25 %	0 %	50 %	254791150
258	NC_013008	TGC	2	6	13498	13503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254791150
259	NC_013008	ACA	2	6	13528	13533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254791150
260	NC_013008	CG	3	6	13576	13581	0 %	0 %	50 %	50 %	254791150
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262	NC_013008	TCT	2	6	13689	13694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254791150
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